Άμεσα συνδεδεμένη με την ιστορία της Βασιλικής του Αγίου Μάρκου είναι η τουρκική επιγραφή που έφεραν στο «φως» οι εργασίες αναστήλωσης του μνημείου.
Η τουρκική επιγραφή, που φέρει την χρονολογία 1811-12, βρισκόταν «κρυμμένη, πίσω από μία αποθήκη.
Είναι χαραγμένη πάνω σε μαρμάρινη πλάκα και περιλαμβάνει τις ευχαριστίες προς τον Δεφτεδάρ Πασά για την αναστήλωση του, τότε, τζαμιού που είχε υποστεί μεγάλες καταστροφές από σεισμό.
Την μετάφραση της επιγραφής ανέλαβε ο δήμος Ηρακλείου, που θα προχωρήσει στην ανάδειξή της, σε συνεργασία με την αρμόδια Αρχαιολογική Υπηρεσία.
